Details for gene set GOBP_PHOSPHOLIPID_BIOSYNTHETIC

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Breast.Breast.cls #Breast_30-39_versus_Breast_70-79.Breast.cls #Breast_30-39_versus_Breast_70-79_repos
Phenotype	Breast.cls#Breast_30-39_versus_Breast_70-79_repos
Upregulated in class	Breast_30-39
GeneSet	GOBP_PHOSPHOLIPID_BIOSYNTHETIC_PROCESS
Enrichment Score (ES)	0.5647453
Normalized Enrichment Score (NES)	1.6718
Nominal p-value	0.0035778175
FDR q-value	0.27147382
FWER p-Value	0.749

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	TITLE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	ORMDL3	NA	183	0.683	0.0070	Yes
2	MTMR3	NA	209	0.668	0.0166	Yes
3	PIP4K2B	NA	221	0.663	0.0264	Yes
4	SACM1L	NA	227	0.660	0.0363	Yes
5	STARD7	NA	457	0.603	0.0412	Yes
6	LPGAT1	NA	546	0.586	0.0484	Yes
7	PITPNM3	NA	558	0.584	0.0570	Yes
8	AGK	NA	698	0.562	0.0630	Yes
9	CSNK2A1	NA	759	0.556	0.0703	Yes
10	SLC27A1	NA	819	0.549	0.0775	Yes
11	FIG4	NA	851	0.545	0.0852	Yes
12	GPAA1	NA	854	0.545	0.0934	Yes
13	PIGM	NA	877	0.543	0.1012	Yes
14	DOLK	NA	894	0.542	0.1090	Yes
15	PISD	NA	944	0.536	0.1162	Yes
16	VAC14	NA	970	0.533	0.1238	Yes
17	INPP5K	NA	1017	0.528	0.1310	Yes
18	PIGV	NA	1029	0.528	0.1387	Yes
19	PIGS	NA	1039	0.526	0.1465	Yes
20	ABHD3	NA	1049	0.525	0.1543	Yes
21	CEPT1	NA	1300	0.503	0.1573	Yes
22	PIK3CB	NA	1307	0.502	0.1648	Yes
23	PIKFYVE	NA	1353	0.499	0.1715	Yes
24	MTMR12	NA	1368	0.497	0.1787	Yes
25	CDS2	NA	1391	0.496	0.1858	Yes
26	PIGN	NA	1685	0.477	0.1876	Yes
27	CSNK2A2	NA	1703	0.476	0.1945	Yes
28	DDHD2	NA	1743	0.473	0.2009	Yes
29	PIK3R4	NA	1840	0.466	0.2062	Yes
30	PCYT1A	NA	1993	0.456	0.2103	Yes
31	OCRL	NA	2023	0.454	0.2166	Yes
32	MTMR4	NA	2037	0.454	0.2233	Yes
33	PIGW	NA	2130	0.449	0.2283	Yes
34	RUFY1	NA	2161	0.448	0.2346	Yes
35	CPNE3	NA	2172	0.448	0.2411	Yes
36	INPP4A	NA	2217	0.445	0.2471	Yes
37	PEMT	NA	2261	0.442	0.2530	Yes
38	MTMR9	NA	2410	0.435	0.2568	Yes
39	SLC44A2	NA	2472	0.432	0.2622	Yes
40	PLA2G12A	NA	2515	0.430	0.2679	Yes
41	PIGP	NA	2621	0.426	0.2724	Yes
42	PIK3CA	NA	2652	0.424	0.2783	Yes
43	PTEN	NA	2673	0.423	0.2843	Yes
44	PTPN13	NA	2705	0.422	0.2901	Yes
45	PIK3R1	NA	2739	0.420	0.2959	Yes
46	PIGZ	NA	2762	0.419	0.3018	Yes
47	DGKQ	NA	2788	0.418	0.3076	Yes
48	SGMS2	NA	2903	0.413	0.3118	Yes
49	MTM1	NA	2916	0.412	0.3178	Yes
50	CHKA	NA	3068	0.406	0.3212	Yes
51	DHDDS	NA	3071	0.406	0.3273	Yes
52	GNPAT	NA	3103	0.405	0.3328	Yes
53	NUS1	NA	3201	0.402	0.3371	Yes
54	PI4KA	NA	3246	0.400	0.3423	Yes
55	ACSL3	NA	3331	0.397	0.3468	Yes
56	MBOAT2	NA	3362	0.396	0.3522	Yes
57	PIK3C3	NA	3507	0.391	0.3555	Yes
58	DGKZ	NA	3668	0.385	0.3583	Yes
59	PI4K2A	NA	3675	0.385	0.3640	Yes
60	LPIN3	NA	3734	0.382	0.3687	Yes
61	GPD1L	NA	3756	0.382	0.3741	Yes
62	PTPMT1	NA	3833	0.379	0.3785	Yes
63	ARF3	NA	3888	0.377	0.3832	Yes
64	MTMR7	NA	4199	0.368	0.3830	Yes
65	LCLAT1	NA	4217	0.368	0.3883	Yes
66	PIGB	NA	4552	0.358	0.3875	Yes
67	MTMR1	NA	4630	0.356	0.3915	Yes
68	ABCA2	NA	4634	0.355	0.3968	Yes
69	FAR1	NA	4703	0.353	0.4009	Yes
70	HDHD5	NA	4894	0.348	0.4026	Yes
71	ATM	NA	4915	0.348	0.4075	Yes
72	AGPAT1	NA	4979	0.346	0.4116	Yes
73	PIK3R2	NA	5143	0.342	0.4137	Yes
74	SLC44A1	NA	5167	0.341	0.4185	Yes
75	GPAT4	NA	5223	0.339	0.4226	Yes
76	MPPE1	NA	5286	0.338	0.4265	Yes
77	SELENOI	NA	5319	0.337	0.4310	Yes
78	PLEKHA1	NA	5339	0.336	0.4358	Yes
79	PIGF	NA	5633	0.329	0.4354	Yes
80	INPP5F	NA	5763	0.326	0.4379	Yes
81	PIGC	NA	5925	0.322	0.4398	Yes
82	DPAGT1	NA	5979	0.321	0.4437	Yes
83	MTMR6	NA	6066	0.319	0.4469	Yes
84	DGKE	NA	6163	0.317	0.4499	Yes
85	CWH43	NA	6171	0.317	0.4546	Yes
86	SPHK2	NA	6175	0.317	0.4593	Yes
87	PTDSS1	NA	6348	0.313	0.4609	Yes
88	PIGQ	NA	6397	0.312	0.4647	Yes
89	PI4K2B	NA	6648	0.306	0.4647	Yes
90	SBF1	NA	6786	0.303	0.4668	Yes
91	FITM1	NA	6859	0.302	0.4700	Yes
92	IMPA1	NA	6915	0.301	0.4736	Yes
93	CDIPT	NA	6957	0.300	0.4774	Yes
94	CHKB	NA	7051	0.298	0.4801	Yes
95	PIGX	NA	7148	0.296	0.4828	Yes
96	PLA2G6	NA	7179	0.296	0.4868	Yes
97	DDHD1	NA	7190	0.295	0.4910	Yes
98	PIGG	NA	7224	0.295	0.4949	Yes
99	DGKH	NA	7314	0.293	0.4977	Yes
100	INPPL1	NA	7421	0.290	0.5001	Yes
101	ACP6	NA	7440	0.290	0.5042	Yes
102	LIPI	NA	7580	0.287	0.5059	Yes
103	AGPAT4	NA	7620	0.287	0.5096	Yes
104	PIGO	NA	7764	0.284	0.5112	Yes
105	PI4KB	NA	7834	0.282	0.5142	Yes
106	SH3YL1	NA	7864	0.282	0.5179	Yes
107	ETNK1	NA	7952	0.280	0.5206	Yes
108	PIK3C2A	NA	8112	0.277	0.5218	Yes
109	PLSCR3	NA	8268	0.274	0.5231	Yes
110	RAB4A	NA	8331	0.273	0.5261	Yes
111	PIK3C2G	NA	8342	0.273	0.5300	Yes
112	PLA2G4A	NA	8399	0.272	0.5331	Yes
113	SYNJ1	NA	8722	0.266	0.5312	Yes
114	ETNK2	NA	8802	0.265	0.5337	Yes
115	FITM2	NA	8853	0.264	0.5368	Yes
116	IDI2	NA	8901	0.263	0.5399	Yes
117	LPIN2	NA	9132	0.259	0.5396	Yes
118	PMVK	NA	9260	0.257	0.5411	Yes
119	PIK3CD	NA	9579	0.251	0.5391	Yes
120	SYNJ2	NA	9642	0.250	0.5417	Yes
121	PLD6	NA	9694	0.249	0.5445	Yes
122	CHP1	NA	9977	0.245	0.5431	Yes
123	SLC44A5	NA	10080	0.243	0.5449	Yes
124	PLA2G4D	NA	10114	0.243	0.5479	Yes
125	PIGL	NA	10207	0.241	0.5499	Yes
126	SGMS1	NA	10358	0.239	0.5507	Yes
127	SERINC5	NA	10552	0.236	0.5507	Yes
128	GPAT2	NA	10600	0.235	0.5534	Yes
129	SAMD8	NA	11037	0.229	0.5488	Yes
130	MTMR14	NA	11106	0.227	0.5510	Yes
131	CDS1	NA	11169	0.227	0.5533	Yes
132	ABHD8	NA	11193	0.226	0.5563	Yes
133	PITPNM1	NA	11378	0.223	0.5563	Yes
134	PCYT2	NA	12476	0.208	0.5392	Yes
135	SERINC1	NA	12545	0.207	0.5411	Yes
136	HMGCS1	NA	12572	0.207	0.5437	Yes
137	PIK3C2B	NA	12594	0.206	0.5465	Yes
138	PIP4K2C	NA	12621	0.206	0.5491	Yes
139	PTDSS2	NA	12630	0.206	0.5521	Yes
140	INPP5J	NA	12632	0.206	0.5552	Yes
141	CRLS1	NA	12850	0.203	0.5542	Yes
142	AJUBA	NA	12946	0.201	0.5555	Yes
143	PCTP	NA	13027	0.200	0.5571	Yes
144	MVK	NA	13218	0.198	0.5566	Yes
145	PLEKHA3	NA	13606	0.192	0.5524	Yes
146	RAB14	NA	13732	0.190	0.5529	Yes
147	CAPN2	NA	13794	0.190	0.5547	Yes
148	GGPS1	NA	13940	0.187	0.5548	Yes
149	PGAP3	NA	14096	0.185	0.5548	Yes
150	RAB5A	NA	14128	0.185	0.5570	Yes
151	ABHD5	NA	14212	0.184	0.5583	Yes
152	GPD1	NA	14218	0.184	0.5609	Yes
153	DGKD	NA	14282	0.183	0.5625	Yes
154	AGPAT2	NA	14313	0.182	0.5647	Yes
155	FADS1	NA	14730	0.177	0.5598	No
156	PIGK	NA	14980	0.174	0.5578	No
157	MFSD2A	NA	15023	0.173	0.5597	No
158	IDI1	NA	15163	0.172	0.5597	No
159	FABP3	NA	15369	0.169	0.5585	No
160	PGAP1	NA	15667	0.166	0.5555	No
161	ABHD4	NA	15785	0.164	0.5558	No
162	PIP5K1C	NA	15944	0.162	0.5554	No
163	DOLPP1	NA	16616	0.154	0.5454	No
164	PLA2G10	NA	16686	0.153	0.5464	No
165	PLA2G1B	NA	16700	0.153	0.5485	No
166	AGPAT5	NA	16776	0.152	0.5494	No
167	PLD2	NA	16898	0.150	0.5494	No
168	PIK3R6	NA	17640	0.141	0.5379	No
169	PLA2G4B	NA	18222	0.134	0.5292	No
170	NR1H4	NA	18353	0.132	0.5289	No
171	LPIN1	NA	18498	0.130	0.5282	No
172	CLN3	NA	18819	0.126	0.5242	No
173	CPNE7	NA	19143	0.122	0.5201	No
174	MBOAT7	NA	19526	0.117	0.5148	No
175	PGAP2	NA	19740	0.114	0.5126	No
176	PIK3R3	NA	20047	0.111	0.5087	No
177	DPM2	NA	20379	0.107	0.5042	No
178	RAB38	NA	20404	0.106	0.5054	No
179	SERAC1	NA	20639	0.104	0.5026	No
180	SLC44A3	NA	20682	0.103	0.5034	No
181	PIGT	NA	20709	0.103	0.5045	No
182	CHPT1	NA	21006	0.099	0.5005	No
183	PIP4K2A	NA	21146	0.098	0.4995	No
184	IDH1	NA	21302	0.096	0.4981	No
185	SLC44A4	NA	21317	0.096	0.4992	No
186	PCYT1B	NA	21489	0.094	0.4975	No
187	FDPS	NA	21726	0.091	0.4945	No
188	PLD1	NA	21765	0.091	0.4952	No
189	PIP5K1A	NA	22104	0.087	0.4903	No
190	HTR2B	NA	22228	0.086	0.4893	No
191	FGF2	NA	22312	0.085	0.4891	No
192	PIK3R5	NA	22627	0.081	0.4845	No
193	SPTLC2	NA	22724	0.080	0.4840	No
194	LCAT	NA	22918	0.078	0.4816	No
195	GPAT3	NA	23098	0.076	0.4795	No
196	PLEKHA8	NA	23200	0.075	0.4787	No
197	MBOAT1	NA	23251	0.075	0.4790	No
198	ALPI	NA	23354	0.073	0.4782	No
199	SRD5A3	NA	23628	0.071	0.4742	No
200	AGPAT3	NA	23670	0.070	0.4745	No
201	PIK3CG	NA	23809	0.069	0.4730	No
202	DGKG	NA	23961	0.067	0.4713	No
203	INPP4B	NA	23997	0.067	0.4716	No
204	LIPH	NA	24369	0.063	0.4658	No
205	ALOX15	NA	24387	0.063	0.4664	No
206	DGKA	NA	24737	0.060	0.4609	No
207	PDGFA	NA	25687	0.051	0.4442	No
208	PLA2G2E	NA	26126	0.047	0.4368	No
209	PIP5K1B	NA	26213	0.046	0.4359	No
210	STARD10	NA	26655	0.042	0.4285	No
211	LPCAT2	NA	26841	0.041	0.4257	No
212	PIGU	NA	27270	0.037	0.4183	No
213	PLCG2	NA	27591	0.035	0.4130	No
214	MVD	NA	28223	0.031	0.4018	No
215	DPM1	NA	28550	0.029	0.3963	No
216	GPAM	NA	28801	0.027	0.3921	No
217	TAZ	NA	28909	0.027	0.3905	No
218	MTMR2	NA	29851	0.021	0.3735	No
219	INPP5E	NA	30241	0.019	0.3667	No
220	HMGCS2	NA	30508	0.018	0.3620	No
221	PLEKHA2	NA	31306	0.014	0.3476	No
222	PLA2G2A	NA	31517	0.013	0.3439	No
223	CPNE1	NA	32664	0.008	0.3229	No
224	PIGH	NA	33069	0.007	0.3156	No
225	PLA2G2F	NA	33945	0.001	0.2995	No
226	MIR30C1	NA	36230	0.000	0.2575	No
227	TAMM41	NA	39464	-0.005	0.1980	No
228	PLA2G2D	NA	40056	-0.012	0.1873	No
229	HTR2A	NA	40373	-0.016	0.1817	No
230	ADGRF5	NA	40792	-0.022	0.1744	No
231	TMEM38B	NA	41004	-0.024	0.1709	No
232	TPTE2	NA	41312	-0.027	0.1656	No
233	CHAT	NA	41704	-0.032	0.1589	No
234	PLA2G5	NA	42850	-0.047	0.1385	No
235	ACHE	NA	43273	-0.052	0.1316	No
236	PLA2G4C	NA	43475	-0.055	0.1287	No
237	FABP5	NA	43523	-0.055	0.1286	No
238	LPCAT1	NA	44007	-0.062	0.1207	No
239	ISYNA1	NA	44963	-0.076	0.1043	No
240	PNPLA3	NA	45113	-0.078	0.1027	No
241	LPCAT4	NA	45175	-0.079	0.1028	No
242	PITPNM2	NA	45598	-0.085	0.0963	No
243	ABCA8	NA	46577	-0.100	0.0798	No
244	ARF1	NA	46706	-0.102	0.0790	No
245	PPARD	NA	47058	-0.108	0.0742	No
246	HTR2C	NA	47543	-0.117	0.0670	No
247	ETNPPL	NA	47794	-0.122	0.0643	No
248	PHOSPHO1	NA	48535	-0.135	0.0527	No
249	HEXB	NA	48800	-0.140	0.0499	No
250	PLEKHA4	NA	48933	-0.143	0.0497	No
251	DPM3	NA	48935	-0.143	0.0518	No
252	LPCAT3	NA	49243	-0.150	0.0484	No
253	PDGFB	NA	49822	-0.162	0.0402	No
254	CSNK2B	NA	49931	-0.165	0.0407	No
255	PGS1	NA	50423	-0.175	0.0344	No
256	APOA2	NA	50997	-0.189	0.0267	No
257	MTMR8	NA	51205	-0.194	0.0258	No
258	PIGA	NA	51410	-0.200	0.0251	No
259	PYURF	NA	51900	-0.212	0.0193	No
260	APOA1	NA	51971	-0.214	0.0212	No
261	BMX	NA	53116	-0.251	0.0039	No
262	DGKB	NA	53337	-0.263	0.0039	No
263	INPP5D	NA	54339	-0.407	-0.0084	No
264	PLSCR1	NA	54364	-0.417	-0.0026	No
265	CPNE6	NA	54424	-0.444	0.0031	No